Ich habe mein Filterbecken ähnlich aufgebaut, nur das die Trennscheibe zur Pumpenabteilung ebenfalls ein paar cm vom Boden weg ist. Der Sinn dahinter ist, dass sich die Verdunstung über das ganze Filterbecken verteilt und nicht nur in der letzten Kammer.
Da unsere Filterbecken dem Grunde nach gleich sind, würde ich dir für den mittleren Teil grobe Filterschwämme empfehlen.
Einfach von rechts nach links einklemmen, sodass das Wasser wie bei einem HMF durchlaufen muss. Zwischen den Schwämmen würde ich ein paar cm Platz lassen, damit später Ablagerungen dazwischen einfach abgesaugt werden können. Die Schwämme würde ich heute in einer Dicke von 5cm nehmen. Die lassen sich einfacher auswaschen, als mit 10cm Dicke.